曹县人民医院有新老两个院区组成。老院区位于县城西关闽江路健康新村1号，始建于1949年，占地70亩，建筑面积34520平方米，业务用房21137平方米，是全县医疗、教学、科研、急救中心，是离休干部、城镇职工、城镇居民医保和新农合定点医院，是国家爱婴医院、山东省优质服务百佳医院和省级精神文明单位。老院区开设计17个医技和21个临床学科，开放病床647张。医院现有人员871人，其中硕士13人、本科278人、专科246人、中专259人、其他88人。高级职称90人（正高15人、副高75人）、中级职称401人、初级职称359人、其他111人。医疗人员279人、护理人员216人、医技人员101人、药政人员52人、行管后勤133人、其他人员90人。2013年九月，曹县人民医院新院区建设完成，建设面积22000平米，设置床位450张，总投资约5000余万元。大楼将按现代化、信息化、多元化要求建设，设有单人病房、双人病房、普通病房、中心供氧、中心吸引、自动空气调节系统、自动消防监控系统、信息交换通讯系统、物流传输系统、无线呼叫、急救通讯网络等现代化设施。大大改善病人的住院条件，满足不同层次病人的多种需求，同时大大缓解医疗、科研资源不足的局面，为医护人员提供更舒适的工作学习环境，大幅提升医院综合实力。除儿科、妇科外，其他科室已经搬到新院区。
医院设临床科室16个， 内科形成了心血管、神经、呼吸、消化、内分泌、血液、急救、康复、中西医结合等专业。 外科形成 了普外、颅脑外、泌尿外、骨外、纤维外、胸外、创伤、腹腔镜等专业。
医院承担了省级研究课题， 获国家专利一项， 获得省和地区多项科技成果奖励 。 着书11部， 发表学术论文600余篇， 其中*26篇。
德国西门子1.5T18通道超导核磁共振、美国飞利浦64排128层螺旋CT、日本岛津数字胃肠、美国柯达DR、德国飞利浦DR、美国飞利浦心脏彩超、德国西门子全身彩超、日本阿洛卡腹部彩超、日本日立全自动生化分析仪、美国贝克曼化学发光免疫分析系统、法国ABX全自动血液分析仪、法国生物-梅里埃全自动微生物鉴定及药敏分析系统、德国尿液分析工作站及血凝仪、德国徕卡快速切片机、移动C臂、血管造影、电子胃镜、电子结肠镜、手术显微镜、高压氧舱、制氧机组、手术腹腔镜、DASH2000、DASH3000多功能监护仪、全自动呼吸机、英国攀龙高档麻醉机和深圳迈瑞麻醉机等大型高端医疗设备近百（台）件。
1993年医院投入使用了微机网络管理系统， 复盖了行政事务、物资管理和临床医技科室。曹县人民医院在长期的实践中创立了一套较为完善的医德医风考核机制， 实施多媒体电视临近， 组成多类单项考评小组， 聘请社会监督员， 面向全社会接受评议监督， 对职工的行为进行监督考评， 并每月兑现奖惩， 对行业行风建设起到了极大的促进作用。 医院始终坚持医疗工作为中心， 大力弘扬实事求是， 无私奉献的医德风范， 深得病人赞誉。 荣获山东省优质服务百佳医院称号。 十年树木， 百年树人， 为了使患者得到及时， 有效的医疗服务， 医院实施了人才培养战略， 采取基本训练与专业技能相结合； 基础理论与业务实践相结合；学历教育与外出深造相结合的措施。 经常邀请医学专家、教授讲学、会诊， 选送青年技术骨干到医学院校和京、沪、济大医院进修， 开展多渠道培养人才，。 学科建设得到加强， 阶梯结构已经形成， 各专业配备了较高水平的学科带头人。 仅此一项， 自1990年以来， 每年投入十余万元。 曹县人民医院领导班子团结、务实、勇于开拓进取。建院五十年来， 在各级政府、社会各界的关心支持下， 经过几代医务员工的共同努力， 医院多次获得地区文明医院， 是集医疗、教学、科研、急救、康复为一体的综合性二级甲等医院。 “技术求精， 病人至上，乐于奉献， 务实创新”的院训永远激励着曹县人民医院全体员工不断奋进！